全市辖8个街道、4个镇、5个乡、2个园区：
萨依布依街道、墩买里街道、伊犁河路街道、喀赞其街道、都来提巴格街道、琼库勒克街道、艾兰木巴格街道、解放路街道
巴彦岱镇、潘津镇、英也尔镇、达达木图镇、汉宾乡、塔什库勒克乡、喀尔墩乡、托格拉克乡、克伯克于孜乡，以及betway必威体育边境经济合作区和伊宁园区。
2011年全市辖8个街道、1个镇、8个乡：
萨依布依街道、墩买里街道、伊犁河路街道、喀赞其街道、都来提巴格街道、琼库勒克街道、艾兰木巴格街道、解放路街道、
巴彦岱镇、
潘津乡、英也尔乡、汉宾乡、塔什库勒克乡、哈尔墩乡、托格拉克乡、克伯克于孜乡、达达木图乡，以及betway必威体育边境经济合作区。
2016年4月8日上午，betway必威体育潘津乡正式撤乡设镇，结束了62年乡建制历史。
现辖8个街道、2个镇、7个乡。
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